Los hoteles de cinco estrellas en Cusco se concentran en el centro histórico, a pocas cuadras de la Plaza de Armas y el Koricancha. Las tarifas oscilan entre 200 y 500 USD por noche, e incluyen servicios como desayuno buffet, habitaciones con oxígeno para mitigar la altitud (3,400 m s. n. m.), y traslado al aeropuerto. Barrios como San Blas o el propio centro colonial ofrecen fácil acceso a los principales atractivos. Es recomendable reservar con antelación, especialmente durante la temporada alta (mayo-septiembre), y confirmar si el hotel incluye asistencia para la aclimatación.
Entre los alojamientos mejor valorados destaca el Monasterio, A Belmond Hotel, Cusco, un antiguo monasterio de 1592 con arte religioso en los muros y dos restaurantes de cocina andina. El Palacio Del Inka, A Luxury Collection Hotel, Cusco, ubicado frente al Koricancha, ofrece piscina climatizada y clases de pisco. El Casa Andina Premium Cusco, con vistas a la plaza Limacpampa, sirve especialidades del valle sagrado en Alma Restaurante & Bar. El Casa Cartagena Boutique Hotel & Spa combina suites con balcones coloniales, jardín y spa. Por último, el JW Marriott El Convento Cusco, levantado sobre un convento del siglo XVI, cuenta con patio barroco, oxígeno en todas las habitaciones y dos opciones gastronómicas.